CESAR AUGUSTO BONAVIDES MARTINEZ



DATOS GENERALES
Nombre completo   CESAR AUGUSTO BONAVIDES MARTINEZ
Máximo nivel de estudios   MAESTRÍA
Antigüedad académica en la UNAM   19 años
NOMBRAMIENTOS
Vigente   TECNICO ACADEMICO TITULAR C TC Definitivo
Centro de Ciencias Genómicas
Desde 16-11-2014
TECNICO ACADEMICO TITULAR B TC Definitivo
Centro de Ciencias Genómicas
Desde 01-03-2012 hasta 15-11-2014
TECNICO ACADEMICO TITULAR B TC No Definitivo
Centro de Ciencias Genómicas
Desde 01-01-2008 (fecha inicial de registros en el SIIA) hasta 28-02-2012
ESTIMULOS, PROGRAMAS, PREMIOS Y RECONOCIMIENTOS
* SNI I2012 - 2014
* SNI C2009 - 2011
* PRIDE C - 2024
INFORMACIÓN DE PUBLICACIONES
Firmas  
Bonavides C. Bonavides-martinez C. Bonavides-Martinez, C Bonavides-Martinez, Cesar
ID's SCOPUS  
12776727100 56000903200 56162107100
Áreas de conocimiento  
Biochemistry & molecular biology Biochemistry and molecular biology Genetics and heredity Jcs 2008 Mathematical and computational biology
Microbiology Multidisciplinary sciences Scie jcr Biomedical engineering Genetics
Information systems Microbiology Microbiology (medical)
Coautorías con entidades de la UNAM  
  • Consejo Técnico y Coordinación de la Investigación Científica
  • Centro de Ciencias Genómicas
  • Centro de Ciencias Aplicadas y Desarrollo Tecnológico
  • Laboratorio Internacional de Investigación Sobre el Genoma Humano
  • Instituto de Investigaciones Biomédicas
  • Instituto de Biotecnología
 Revistas en las que ha publicado  (7):
  1. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, Reino Unido (2017, 2019)
  2. EcoSal Plus, Estados Unidos America (2014, 2018, 2023)
  3. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Suiza (2022)
  4. Frontiers in Genetics, Suiza (2024)
  5. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, Suiza (2021)
  6. Microbial Genomics, (2022)
  7. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, Reino Unido (2001, 2002, 2004, 2006, 2007, 2008, 2009, 2011, 2013, 2016, 2017, 2019, 2024)


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# Título del documento Autores Año Revista Fuente Citas WoS Citas Scopus
1RegulonDB v12.0:ã comprehensive resource of transcriptional regulation in E. coli K-12Coautor: Bonavides-Martínez C., Salgado H., Gama-Castro S., Lara P., et al.2024NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 001102810900001
Scopus-id: 2-s2.0-85181777832
2327
2Flexible gold standards for transcription factor regulatory interactions in Escherichia coli K-12: architecture of evidence typesCoautor: Bonavides-Martínez C., Lara P., Gama-Castro S., Salgado H., et al.2024Frontiers in GeneticsWoS-id: 001186999100001
Scopus-id: 2-s2.0-85188101282
11
3The EcoCyc Database (2023)Coautor: Bonavides-martinez C., Karp P.D., Paley S., Caspi R., et al.2023EcoSal PlusScopus-id: 2-s2.0-85176768413
037
4Sensory Systems and Transcriptional Regulation in Escherichia coliCoautor: Bonavides-Martinez, Cesar, Femerling, Georgette, Gama-Castro, Socorro, Lara, Paloma, et al.2022Frontiers in Bioengineering and BiotechnologyWoS-id: 000761661300001
Scopus-id: 2-s2.0-85125402152
56
5RegulonDB 11.0: Comprehensive high-throughput datasets on transcriptional regulation in Escherichia coli K-12Coautor: Bonavides-Martínez C., Tierrafría V.H., Rioualen C., Salgado H., et al.2022Microbial GenomicsWoS-id: 000812938700011
Scopus-id: 2-s2.0-85130765382
6567
6The EcoCyc Database in 2021Coautor: Bonavides-Martinez, Cesar, Keseler, Ingrid M., Gama-Castro, Socorro, Mackie, Amanda, et al.2021FRONTIERS IN MICROBIOLOGYWoS-id: 000683854200001
Scopus-id: 2-s2.0-85112326830
152156
7RegulonDB v 10.5: tackling challenges to unify classic and high throughput knowledge of gene regulation in E. coli K-12Coautor: Bonavides-Martínez C., Santos-Zavaleta A., Salgado H., Gama-Castro S., et al.2019NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000462587400034
Scopus-id: 2-s2.0-85059797142
248255
8Bioinformatics in Latin America and SoIBio impact, a tale of spin-off and expansion around genomes and protein structures2ᵒ autor: Bonavides-Martínez C., De Las Rivas J., Campos-Laborie F.J.2019BRIEFINGS IN BIOINFORMATICSWoS-id: 000462706200004
Scopus-id: 2-s2.0-85063712525
912
9The EcoCyc DatabaseCoautor: Bonavides-Martinez C., Karp P.D., Ong W.K., Paley S., et al.2018EcoSal PlusScopus-id: 2-s2.0-85056491267
061
10The EcoCyc database: reflecting new knowledge about Escherichia coli K-12Coautor: Bonavides-Martinez, Cesar, Keseler, Ingrid M., Mackie, Amanda, Santos-Zavaleta, Alberto, et al.2017NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000396575500076
Scopus-id: 2-s2.0-85015989839
391402
11Corrigendum: Bioinformatics in Latin America and SoIBio impact, a tale of spin-off and expansion around genomes and protein structures [Briefings in Bioinformatics, (2017)] doi: 10.1093/bib/bbx0642ᵒ autor: Bonavides-Martínez C., De Las Rivas J., Campos-Laborie F.J.2017BRIEFINGS IN BIOINFORMATICSWoS-id: 000416744400020
Scopus-id: 2-s2.0-85039170768
14
12RegulonDB version 9.0: high-level integration of gene regulation, coexpression, motif clustering and beyondCoautor: Bonavides-Martinez, Cesar, Gama-Castro, Socorro, Salgado, Heladia, Santos-Zavaleta, Alberto, et al.2016NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000371261700018
Scopus-id: 2-s2.0-84976874666
351370
13The EcoCyc databaseCoautor: Bonavides-Martinez C., Karp P.D., Weaver D., Paley S., et al.2014EcoSal PlusScopus-id: 2-s2.0-84932633215
058
14RegulonDB v8.0: Omics data sets, evolutionary conservation, regulatory phrases, cross-validated gold standards and moreCoautor: Bonavides-Martinez, C, Salgado, H, Peralta-Gil, M, Gama-Castro, S, et al.2013NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000312893300028
Scopus-id: 2-s2.0-84876543942
328343
15EcoCyc: fusing model organism databases with systems biologyCoautor: Bonavides-Martínez C., Keseler I.M., Mackie A., Peralta-Gil M., et al.2013NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000312893300086
Scopus-id: 2-s2.0-84876556918
432445
16RegulonDB version 7.0: Transcriptional regulation of Escherichia coli K-12 integrated within genetic sensory response units (Gensor Units)Coautor: Bonavides-Martínez C., Gama-Castro S., Salgado H., Peralta-Gil M., et al.2011NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000285831700018
Scopus-id: 2-s2.0-78651299341
280296
17EcoCyc: a comprehensive database of Escherichia coli biologyCoautor: Bonavides-Martinez C., Keseler I.M., Collado-Vides J., Santos-Zavaleta A., et al.2011NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000285831700092
Scopus-id: 2-s2.0-78651281217
352383
18EcoCyc: A comprehensive view of Escherichia coli biology2ᵒ autor: Bonavides-Martínez C., Keseler I.M., Collado-Vides J., Gama-Castro S., et al.2009NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000261906200084
Scopus-id: 2-s2.0-58149179979
281305
19RegulonDB (version 6.0): gene regulation model of Escherichia coli K-12 beyond transcription, active (experimental) annotated promoters and Textpresso navigationCoautor: Bonavides-Martinez, C, Gama-Castro, S, Jimenez-Jacinto, V, Peralta-Gil, M, et al.2008NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000252545400022
Scopus-id: 2-s2.0-38549140094
375404
20Multidimensional annotation of the Escherichia coli K-12 genomeCoautor: Bonavides-martinez C., Karp P.D., Keseler I.M., Shearer A., et al.2007NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000252125900021
Scopus-id: 2-s2.0-38049007503
135151
21RegulonDB (version 5.0): Escherichia coli K-12 transcriptional regulatory network, operon organization, and growth conditions.Coautor: Bonavides-Martínez C., Salgado H., Gama-Castro S., Peralta-Gil M., et al.2006NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000239307700086
Scopus-id: 2-s2.0-33644873438
272304
22RegulonDB (version 4.0): Transcriptional regulation, operon organization and growth conditions in Escherichia coli K-12Coautor: Bonavides-Martínez C., Salgado H., Gama-Castro S., Martínez-Antonio A., et al.2004NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000188079000071
Scopus-id: 2-s2.0-9144270496
192226
23The EcoCyc databaseCoautor: Bonavides C., Karp P.D., Riley M., Saier M., et al.2002NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000173077100013
Scopus-id: 2-s2.0-0036084127
307349
24RegulonDB (version 3.2): Transcriptional regulation and operon organization in Escherichia coli K-12Coautor: Bonavides-Martínez C., Salgado H., Santos-Zavaleta A., Gama-Castro S., et al.2001NUCLEIC ACIDS RESEARCHWoS-id: 000166360300017
Scopus-id: 2-s2.0-0035162782
181191
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# Título del capítulo Título del libro Autores Alcance Año ISBN Fuente
1Developing biomedical applications in the framework of EELAHandbook Of Research On Grid Technologies And Utility Computing: Concepts For Managing Large-Scale ApplicationsBonavides C., Aparicio G., Blanco F., et al.Capítulo de un Libro20099781605661841Scopus-id: 2-s2.0-84900603256
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